Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TAF1AQ15573 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.1 ms