Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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PTCH1Q13635 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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