Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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CUL1Q13616 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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CUL1Q13616 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CUL1Q13616 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.81
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