Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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