Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
TRIM28Q13263 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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