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| NME3 | Q13232 | RNU1-18P-201 | ENST00000363062 | 164 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | U3.15-201 | ENST00000365398 | 212 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-1151P-201 | ENST00000384684 | 107 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | DSTNP4-201 | ENST00000399472 | 474 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | MIR1183-201 | ENST00000408856 | 89 nt | BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | REV3L-IT1-201 | ENST00000411895 | 382 nt | TSL 5 BASIC | 3.82 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NME3 | Q13232 | BTBD9-AS1-201 | ENST00000412822 | 560 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
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| NME3 | Q13232 | MED28P5-201 | ENST00000528254 | 438 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AL356215.1-201 | ENST00000528366 | 1102 nt | TSL 2 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AP001999.2-201 | ENST00000529417 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC124293.1-201 | ENST00000530034 | 493 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | STX3-204 | ENST00000530221 | 534 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | PDZD9-203 | ENST00000537222 | 1068 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC027288.1-203 | ENST00000552167 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC017100.2-201 | ENST00000584628 | 355 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | LINC00907-208 | ENST00000593051 | 1092 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC063944.1-210 | ENST00000593837 | 519 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC013468.1-201 | ENST00000608680 | 598 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC007308.1-201 | ENST00000608856 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | CT45A5-202 | ENST00000617203 | 726 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | LINC01232-201 | ENST00000625254 | 836 nt | TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | FAM157B-203 | ENST00000639350 | 358 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | TRIQK-214 | ENST00000521988 | 3672 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | MYSM1-203 | ENST00000472487 | 7785 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AK9-201 | ENST00000285397 | 2566 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | CEP170-202 | ENST00000366542 | 6828 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | SULT1B1-201 | ENST00000310613 | 7115 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | SLC16A10-201 | ENST00000368850 | 10051 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | AC008725.1-201 | ENST00000605123 | 2263 nt | BASIC | 3.81 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | SLC38A2-209 | ENST00000551374 | 2802 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | IL23R-202 | ENST00000395227 | 1459 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | TTC41P-203 | ENST00000548527 | 1475 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | ATXN3-248 | ENST00000558190 | 26812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | PSG6-202 | ENST00000292125 | 1391 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | ADGRL4-201 | ENST00000370742 | 3527 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | RPS4XP5-202 | ENST00000449995 | 1334 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | DCAF13P1-201 | ENST00000495256 | 1330 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | COX7B2-201 | ENST00000355591 | 542 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| NME3 | Q13232 | RNU6-353P-201 | ENST00000364266 | 108 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |