Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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NME3Q13232 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NME3Q13232 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NME3Q13232 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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