Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 DLG2-202ENST00000330014 2789 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 MS4A7-202ENST00000358246 2871 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
FOXC1Q12948 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms