Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPN13Q12923 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
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