Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VPREB1P12018 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms