Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DMDP11532 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DMDP11532 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DMDP11532 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DMDP11532 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DMDP11532 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DMDP11532 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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