Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RFXAPO00287 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RFXAPO00287 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RFXAPO00287 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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RFXAPO00287 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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RFXAPO00287 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RFXAPO00287 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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