Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ERVV-2B6SEH9 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms