Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms