Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC073115.2-201ENST00000416708 555 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC111200.2-201ENST00000418877 505 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL731567.1-201ENST00000435635 462 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 GHRL-207ENST00000437422 443 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL159166.1-201ENST00000437430 329 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL12P44-201ENST00000442319 502 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL4P2-201ENST00000447259 1282 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL211P-201ENST00000485246 276 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC104123.1-202ENST00000511775 581 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP190-201ENST00000516079 286 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 C14orf166-206ENST00000556760 851 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC02191-201ENST00000568036 518 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SL15P-201ENST00000582825 301 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC008385.1-201ENST00000604421 355 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 uc_338.23-201ENST00000614169 164 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FBXW7-204ENST00000393956 1735 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 OR13H1-201ENST00000338616 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 COX17P1-201ENST00000378775 192 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 CYCSP5-201ENST00000415043 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ANKRD39Q53RE8 AL359711.1-201ENST00000441999 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms