Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
IMPG1Q17R60 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms