Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDKN3Q16667 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDKN3Q16667 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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