Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FXNQ16595 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms