Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
PTCH1Q13635 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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PTCH1Q13635 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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PTCH1Q13635 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTCH1Q13635 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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