Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
TRAF1Q13077 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAF1Q13077 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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