Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
TSPOP30536 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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