Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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HOXD10P28358 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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HOXD10P28358 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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HOXD10P28358 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HOXD10P28358 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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