Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRGP23470 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPRGP23470 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms