Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
TIMMDC1Q9NPL8 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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