Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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FOXQ1Q9C009 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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FOXQ1Q9C009 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXQ1Q9C009 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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