Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GTF3C6Q969F1 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GTF3C6Q969F1 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms