Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC96Q2M329 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC96Q2M329 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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CCDC96Q2M329 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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CCDC96Q2M329 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CCDC96Q2M329 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CCDC96Q2M329 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CCDC96Q2M329 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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