Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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RTL8BQ17RB0 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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RTL8BQ17RB0 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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RTL8BQ17RB0 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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RTL8BQ17RB0 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
RTL8BQ17RB0 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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