Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
NDUFA9Q16795 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
NDUFA9Q16795 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms