Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SGCBQ16585 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
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SGCBQ16585 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SGCBQ16585 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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SGCBQ16585 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SGCBQ16585 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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