Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms