Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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SEC23BQ15437 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SEC23BQ15437 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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