Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms