Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NFIXQ14938 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms