Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SF3B2Q13435 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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