Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
AP3B2Q13367 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
AP3B2Q13367 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms