Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
IFT88Q13099 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms