Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHD3Q12873 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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