Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF9Q00978 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF9Q00978 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms