Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
NFKB1P19838 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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NFKB1P19838 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFKB1P19838 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFKB1P19838 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFKB1P19838 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NFKB1P19838 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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