Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms