Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
BRD3Q15059 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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BRD3Q15059 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BRD3Q15059 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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