Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms