Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ATP1A4Q13733 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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