Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TOP3AQ13472 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TOP3AQ13472 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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