Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SP140Q13342 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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SP140Q13342 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SP140Q13342 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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