Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPRBP23467 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPRBP23467 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPRBP23467 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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PTPRBP23467 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPRBP23467 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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