Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4Q9P0V3 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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