Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
FOXQ1Q9C009 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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