Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
USP9XQ93008 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms