Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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